Изначально в фильме присутствовали достаточно мрачные элементы сюжетной линии, как, к примеру, эпизод, в котором Великий Герцог на кухне запекает в пироге живого детёныша скунса, а пирог съёдает. Эту сцену из мультфильма было решено вырезать. По словам одного из режиссёров и продюсеров Гари Голдмана, сделано это было отнюдь не из желания пощадить чувства юных зрителей, а по вполне прозаической причине. На основанную Доном Блутом ирландско-американскую анимационную студию Sullivan Bluth Studios (впоследствии Don Bluth Entertainment) поступила жалоба от дистрибьюторов – причём, жалоба не на жестокость сюжетных линий, а на то, что слишком много случаев жестокого обращением с детьми происходит именно на кухнях, и в них неизменно задействованы кухонные принадлежности.
Глен Кэмпбелл (он озвучивал петуха Шантеклера) дружил с Элвисом Пресли и иногда по-доброму его пародировал. Прекратил он это делать только со смертью певца. В этом проекте он снова в пении своего персонажа подражал Элвису.
Сцену в финале, где игра актёров сочетается с анимацией, включили в мультфильм на волне успеха основанного на этом приёме проекта «Кто подставил кролика Роджера» (1988). Точно так же шикарный образ фазана Голди (этот персонаж говорил голосом Эллен Грин) несёт в себе черты Джессики из мультфильма 1988 года. После предпросмотров, однако, руководство студии Goldcrest Films велело аниматорам изменить образ Голди и декольте убрать.
Дон Блут вырос на ферме, и при работе над сценой, в которой семейство котёнка Эдмонда (его озвучивал Тоби Скотт Ганджер) спасает из грязи корову, испытывал серьёзный душевный дискомфорт. Животному дали успокоительное, а Блут постоянно его осматривал, чтобы убедиться, что с коровой всё в порядке. В процессе одного такого просмотра он и заметил, что корова (ей дали кличку Эбигейл) – стельная, т.е. вынашивает телёнка. По счастью, участие в съёмках на Эбигейл никак не сказалось, и в положенное время она разродилась телёнком, которого по решению Блута назвали Клиффордом.
Съёмки сцены, в которой коготь разбивает окно спальни, были очень дорогими, необходимо было всё сделать как надо в первом же дубле, и Дон Блут, разумеется, очень волновался. Вдобавок во всему, он переживал за Тоби Скотта Ганджера, который лежал на специальной платформе, и которого требовалось в последний момент оттащить в сторону, чтобы до него не дотянулся коготь. Дублёр Ганджера, сам Ганджер и его мать, которая тоже присутствовала на съёмочной площадке, хором заверяли Блута, что волноваться не из-за чего, и что всё будет в порядке. Когда начались съёмки сцены, с одним из колёс, на которых стояла платформа, что-то случилось, и Блут тут же закрыл глаза. По счастью, оттащить Ганджера в сторону успели, и при съёмках никто не пострадал. Блут даже не видел этого дубля, но всё равно был в таком шоке, что съёмки в тот день прекратил.
Для съёмок сцен с живыми актёрами привлекли было Виктора Френча. Френч за первые же четыре дня работы снял значительную часть сцен урагана, но затем из-за внезапно начавшихся болей проект покинул. Вскоре выяснилось, что у него рак лёгких, и через три месяца он скончался. Мультфильм «Новые приключения Пса и его друзей» стал его последним проектом, а всё, что Френч в рамках этого проекта снять не успел, впоследствии доснимал Дон Блут.
